26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0537 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0537  PAP2 family protein  100 
 
 		 293 aa  596  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0694  phosphoesterase PA-phosphatase related  99.55 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000042298  unclonable  0.000000000111992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1372  phosphoesterase, PA-phosphatase related  72.3 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3303  phosphoesterase, PA-phosphatase related  70.73 
 
 		 242 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.306243  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2238  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  49.34 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1848  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  51.46 
 
 		 222 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2021  hypothetical protein  52.11 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4168  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.58 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4862  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.94 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  32.82 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.82 
 
 		 217 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.86 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2865  hypothetical protein  29.59 
 
 		 206 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.423571 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.73 
 
 		 189 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.2 
 
 		 202 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3885  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.46 
 
 		 205 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0673  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.38 
 
 		 205 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.918939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4660  Dual specificity protein phosphatase  26.87 
 
 		 449 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  30.06 
 
 		 471 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  29.45 
 
 		 468 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  29.45 
 
 		 471 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.44 
 
 		 189 aa  42.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  29.45 
 
 		 471 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  29.45 
 
 		 467 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3589  putative PAP2 family protein  28.15 
 
 		 219 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000468424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>