15 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Pars_0384  CDS  NC_009376  333848  334933  1086  ATPase  YP_001152638  unclonable  1.76931e-07  normal  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0385  CDS  NC_009376  335062  335496  435  hypothetical protein  YP_001152639  unclonable  1.75332e-08  normal  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0554  CDS  NC_009376  496036  497466  1431  aldehyde dehydrogenase  YP_001152801  unclonable  2.39131e-07  normal  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0971  CDS  NC_009376  862433  863722  1290  argininosuccinate lyase  YP_001153203  normal  0.0231153  unclonable  1.87264e-13  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0972  CDS  NC_009376  863684  863995  312  hypothetical protein  YP_001153204  decreased coverage  0.00254861  unclonable  9.38099e-14  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0973  CDS  NC_009376  863976  864503  528  hypothetical protein  YP_001153205  decreased coverage  0.00177478  unclonable  1.29242e-13  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_0974  CDS  NC_009376  864625  865611  987  ABC transporter related  YP_001153206  normal  0.0227339  unclonable  1.44331e-13  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_1567  CDS  NC_009376  1418789  1419631  843  CBS domain-containing protein  YP_001153773  normal  unclonable  1.54873e-14  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_1568  CDS  NC_009376  1419679  1420245  567  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  YP_001153774  normal  unclonable  1.11249e-14  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_1569  CDS  NC_009376  1420246  1420977  732  glutaredoxin-like domain-containing protein  YP_001153775  normal  unclonable  1.34585e-14  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_1570  CDS  NC_009376  1421006  1421386  381  hypothetical protein  YP_001153776  normal  unclonable  9.28849e-15  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_1571  CDS  NC_009376  1421413  1422342  930  malate dehydrogenase  YP_001153777  normal  unclonable  1.56495e-14  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_1572  CDS  NC_009376  1422411  1423757  1347  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001153778  normal  unclonable  1.95086e-14  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_2328  CDS  NC_009376  2084262  2084630  369  50S ribosomal protein L18e  YP_001154524  unclonable  6.13044e-09  hitchhiker  1.57231e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Pars_2329  CDS  NC_009376  2084627  2085187  561  50S ribosomal protein L13P  YP_001154525  unclonable  1.42062e-08  hitchhiker  1.69503e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>