11 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bamb_0229  CDS  NC_008390  264604  265524  921  LysR family transcriptional regulator  YP_772123  unclonable  0.00000000369009  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0364  CDS  NC_008390  404330  405241  912  hypothetical protein  YP_772258  unclonable  0.00000000627109  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0468  CDS  NC_008390  531100  532296  1197  cell division protein FtsZ  YP_772361  unclonable  0.0000000208487  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0975  CDS  NC_008390  1064836  1065159  324  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_772868  unclonable  0.000000000429324  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_1260  CDS  NC_008390  1376276  1380223  3948  cellulose synthase domain-containing protein  YP_773152  unclonable  0.00414022  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_1934  CDS  NC_008390  2131194  2132249  1056  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  YP_773824  unclonable  0.0000000179366  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_2288  CDS  NC_008390  2524217  2524594  378  preprotein translocase subunit SecG  YP_774178  unclonable  0.000000000673415  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0007  rRNA  NC_008390  290626  292151  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  0.000000074395  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0034  tRNA  NC_008390  1064655  1064730  76  tRNA-Asn    unclonable  0.000000000129233  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0067  rRNA  NC_008390  2491545  2493070  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  0.0000000751539  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0068  tRNA  NC_008390  2524022  2524106  85  tRNA-Leu    unclonable  0.000000000144281  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>