19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1174 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1174  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  267  4e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0179647  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1484  hypothetical protein  70.27 
 
 
148 aa  165  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1208  hypothetical protein  68.92 
 
 
148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544976  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1271  hypothetical protein  69.4 
 
 
120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0766  hypothetical protein  57.46 
 
 
104 aa  120  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.704694  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0373  hypothetical protein  61.94 
 
 
102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0679  hypothetical protein  70.73 
 
 
191 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1376  hypothetical protein  38.97 
 
 
128 aa  84  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0426  hypothetical protein  47.76 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0532  bacteriophage terminase large (ATPase) subunit and inactivated derivatives-like protein  61.19 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523182  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1828  hypothetical protein  47.01 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0670  hypothetical protein  27.22 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217425  decreased coverage  0.0000800314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4448  uncharacterized conserved protein containing internal repeats  48.98 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528485  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  39.29 
 
 
278 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0484  hypothetical protein  30.49 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0497  hypothetical protein  30.49 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  45.65 
 
 
229 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1451  hypothetical protein  47.5 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000234748  normal  0.258105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2019  hypothetical protein  38.89 
 
 
105 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>