17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4968 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4968  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  32.81 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  32.81 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  31.25 
 
 
154 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  29.69 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  34.55 
 
 
599 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  26.36 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  30.1 
 
 
137 aa  53.9  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  28.44 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  32.99 
 
 
142 aa  52  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  27.83 
 
 
128 aa  47  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  27.38 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  25 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  24.77 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  26.67 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  26.67 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  26.67 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>