21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1428 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1428  DRTGG domain-containing protein  100 
 
 
116 aa  234  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1474  DRTGG domain-containing protein  99.14 
 
 
116 aa  233  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1908  hypothetical protein  53.45 
 
 
116 aa  114  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1337  hypothetical protein  50.86 
 
 
118 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0333  hypothetical protein  43.64 
 
 
117 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0910  DRTGG domain protein  41.44 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0690  hypothetical protein  42.73 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1290  hypothetical protein  48.04 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0914  DRTGG domain, putative  39.64 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0091  DRTGG domain protein  41.59 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0978121  hitchhiker  0.00135297 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3800  DRTGG domain-containing protein  37.84 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000241054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0180  hypothetical protein  33.94 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2147  hypothetical protein  38.74 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0913  hypothetical protein  32.29 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1476  hypothetical protein  29.36 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1430  hypothetical protein  28.87 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0803  hypothetical protein  28.44 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0094  HPr kinase  26.79 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000248452 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1436  DRTGG domain-containing protein  27.88 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1795  DRTGG domain-containing protein  27 
 
 
432 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1761  DRTGG domain-containing protein  27 
 
 
432 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>