23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1908 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1908  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  234  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1337  hypothetical protein  72.17 
 
 
118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1474  DRTGG domain-containing protein  54.31 
 
 
116 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1428  DRTGG domain-containing protein  53.45 
 
 
116 aa  114  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0690  hypothetical protein  45.45 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1290  hypothetical protein  43.24 
 
 
117 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0910  DRTGG domain protein  43.24 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2147  hypothetical protein  41.44 
 
 
117 aa  83.6  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0333  hypothetical protein  39.09 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0180  hypothetical protein  35.14 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0091  DRTGG domain protein  43.1 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0978121  hitchhiker  0.00135297 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0914  DRTGG domain, putative  37.07 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3800  DRTGG domain-containing protein  34.23 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000241054  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0094  HPr kinase  31.25 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000248452 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0913  hypothetical protein  30.43 
 
 
116 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0913  hypothetical protein  31.53 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0803  hypothetical protein  31.53 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0177  iron-sulfur binding hydrogenase  30.48 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1476  hypothetical protein  29.73 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1430  hypothetical protein  32.22 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0693  HPr kinase  27.03 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1436  DRTGG domain-containing protein  27.45 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0336  DRTGG domain-containing protein  30 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>