30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1233 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1233  uncharacterized protein-like protein  100 
 
 
192 aa  390  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000965726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1222  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  390  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1801  hypothetical protein  69.52 
 
 
188 aa  284  4e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00952418  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0650  uncharacterized protein-like protein  65.59 
 
 
190 aa  272  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0324  uncharacterized protein-like protein  63.98 
 
 
188 aa  255  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.155631  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2054  hypothetical protein  46.52 
 
 
187 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1035  hypothetical protein  49.19 
 
 
190 aa  194  7e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.540423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2867  hypothetical protein  47.25 
 
 
193 aa  190  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000146873  hitchhiker  0.000000674307 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0851  hypothetical protein  46.52 
 
 
187 aa  189  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1492  hypothetical protein  43.72 
 
 
192 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000137087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07340  hypothetical protein  42.16 
 
 
193 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000352375  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3001  hypothetical protein  45.36 
 
 
189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000377144  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3043  hypothetical protein  45.36 
 
 
189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00463568  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3759  hypothetical protein  44.26 
 
 
193 aa  178  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000154761  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0647  hypothetical protein  43.96 
 
 
194 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3756  hypothetical protein  46.96 
 
 
185 aa  177  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000107844  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2220  hypothetical protein  45.45 
 
 
185 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.78339e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1096  tRNA (Guanine37-N1) methyltransferase  43.72 
 
 
425 aa  166  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738866  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3308  tRNA (guanine-N1)-methyltransferase  42.08 
 
 
424 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2305  hypothetical protein  40 
 
 
190 aa  161  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2884  tRNA (guanine-N1)-methyltransferase  41.62 
 
 
431 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2145  tRNA (guanine-N1)-methyltransferase  44.32 
 
 
425 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2022  tRNA (guanine-N1)-methyltransferase  42.16 
 
 
425 aa  155  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0252382  normal  0.0841142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2486  tRNA (guanine-N1)-methyltransferase  42.55 
 
 
437 aa  153  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.633084  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1186  hypothetical protein  40.44 
 
 
187 aa  150  8.999999999999999e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00329989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3427  uncharacterized protein-like protein  43.89 
 
 
189 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0734306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2454  hypothetical protein  45.56 
 
 
188 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3489  uncharacterized protein-like protein  43.89 
 
 
189 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.1214e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1094  hypothetical protein  40.78 
 
 
190 aa  137  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0922265  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1789  tRNA (guanine-N1)-methyltransferase  34.04 
 
 
435 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>