40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1400 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1400  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1278  hypothetical protein  67.03 
 
 		 92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.449026  normal  0.349266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2620  hypothetical protein  65.93 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7919  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1507  hypothetical protein  58.7 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362913  normal  0.80475 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1904  hypothetical protein  65.93 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2506  hypothetical protein  59.34 
 
 		 93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4097  hypothetical protein  62.37 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3524  hypothetical protein  50.65 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471773  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1017  hypothetical protein  49.38 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.448533  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2602  hypothetical protein  49.35 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3038  hypothetical protein  49.41 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00723239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4093  hypothetical protein  49.35 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1536  hypothetical protein  48.05 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2216  hypothetical protein  48.05 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0429129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4574  protein of unknown function DUF1153  49.35 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.914351  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4461  protein of unknown function DUF1153  49.35 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0864349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1593  hypothetical protein  48.05 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000171018  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3332  protein of unknown function DUF1153  48.05 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.367393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5060  hypothetical protein  46.34 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.538696  normal  0.441334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3075  protein of unknown function DUF1153  48.05 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5121  hypothetical protein  48.05 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6062  protein of unknown function DUF1153  46.34 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1575  hypothetical protein  46.75 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1937  protein of unknown function DUF1153  48.1 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2185  hypothetical protein  48.75 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1308  hypothetical protein  47.5 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1011  hypothetical protein  44.58 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312156  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0600  hypothetical protein  45.12 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1271  hypothetical protein  45.12 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0170267  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0940  hypothetical protein  45.12 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3847  hypothetical protein  45.12 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0901905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0692  hypothetical protein  45.12 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1456  protein of unknown function DUF1153  45.12 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901982  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0687  hypothetical protein  43.04 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.757409  normal  0.611658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0041  hypothetical protein  43.37 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4750  hypothetical protein  40.96 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2032  hypothetical protein  40.96 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0066  hypothetical protein  36.14 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1310  transposase IS3/IS911  36.54 
 
 		 102 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.599723  normal  0.179562 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1775  transposase  37.31 
 
 		 88 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000443336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>