16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0046 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0046  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  329  8e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3134  hypothetical protein  63.48 
 
 		 184 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408769  hitchhiker  0.0000561841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2499  hypothetical protein  62.61 
 
 		 178 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0623161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0412  hypothetical protein  50.93 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0044  hypothetical protein  57.52 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000485186 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2764  hypothetical protein  65.22 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0841  hypothetical protein  61.46 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5031  hypothetical protein  41.51 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1281  hypothetical protein  43.56 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3632  hypothetical protein  39.81 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2051  hypothetical protein  40.34 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547362  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2956  hypothetical protein  38.83 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3021  hypothetical protein  42 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3214  hypothetical protein  40.2 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2853  hypothetical protein  41.18 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140453  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0636  hypothetical protein  32.65 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.248742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>