14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0540 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  331  4e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00507326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0023  hypothetical protein  51.54 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0996823  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1375  hypothetical protein  42.22 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.48826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1035  hypothetical protein  45.26 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2099  hypothetical protein  33.04 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4416  hypothetical protein  37 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2828  hypothetical protein  35.51 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1404  hypothetical protein  46.43 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1398  hypothetical protein  38.67 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0016  hypothetical protein  34.57 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2332  hypothetical protein  34.23 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00672726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2637  hypothetical protein  33.72 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.813016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1384  cellulase  67.86 
 
 		 137 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.209873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2526  hypothetical protein  34.72 
 
 		 739 aa  42  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.107429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>