279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0092 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
82 aa  164  3e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3621  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  81.48 
 
 
83 aa  138  2e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.344931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  80.25 
 
 
83 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0299  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  79.01 
 
 
84 aa  130  4e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.364798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2936  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  76.83 
 
 
82 aa  130  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1283  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  75.61 
 
 
86 aa  130  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1923  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  74.39 
 
 
88 aa  129  1e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0738  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  76.25 
 
 
85 aa  128  2e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1628  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  73.17 
 
 
88 aa  127  4e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3724  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  76.54 
 
 
85 aa  127  4e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.170973 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0470  ferredoxin  75.61 
 
 
87 aa  127  5e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0581  ferredoxin, 4Fe-4S  75.61 
 
 
88 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0877152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0749  ferredoxin  75.61 
 
 
88 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.726644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0092  ferredoxin  75.61 
 
 
88 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1498  ferredoxin  75.61 
 
 
88 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2926  ferredoxin  75.61 
 
 
88 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0565  ferredoxin, 4Fe-4S  75.61 
 
 
88 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0107127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3124  ferredoxin  75.61 
 
 
88 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.671201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  70.73 
 
 
89 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104146  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  74.07 
 
 
83 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0341  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  74.07 
 
 
83 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0339  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  73.17 
 
 
86 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4998  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  74.07 
 
 
83 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  74.39 
 
 
87 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5124  ferredoxin, 4Fe-4S  74.07 
 
 
83 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0273  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  74.39 
 
 
87 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0509  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  71.95 
 
 
87 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1664  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  74.68 
 
 
89 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0286  4Fe-4S ferredoxin  73.17 
 
 
86 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.508861  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2007  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  69.14 
 
 
83 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.524829  normal  0.21298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0311  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  73.17 
 
 
85 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228615  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0821  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  69.62 
 
 
85 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777892  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0391  ferredoxin protein  74.39 
 
 
82 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2733  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  72.84 
 
 
86 aa  121  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.982043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5349  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  72.84 
 
 
83 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129905  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0581  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  73.17 
 
 
85 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0301396  normal  0.0155307 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0892  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  69.62 
 
 
85 aa  120  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19665  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3613  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  70.89 
 
 
97 aa  120  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.80578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0456  4Fe-4S ferredoxin  71.6 
 
 
83 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  70.37 
 
 
83 aa  119  1e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0752882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04750  ferredoxin (4Fe-4S)  71.6 
 
 
83 aa  119  1e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.949909  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0381  ferredoxin protein  74.68 
 
 
83 aa  119  1e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614433  hitchhiker  0.00782487 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0327  putative 4Fe-4S ferredoxin  69.14 
 
 
82 aa  119  1e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4137  ferredoxin  71.95 
 
 
85 aa  119  1e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0416  ferredoxin  70.37 
 
 
83 aa  119  1e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3225  ferredoxin  69.14 
 
 
99 aa  119  1e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313606 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0360  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  69.14 
 
 
82 aa  119  1e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.122203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1558  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  73.42 
 
 
81 aa  119  1e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1929  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  70.37 
 
 
84 aa  119  1e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121325  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  69.51 
 
 
88 aa  118  2e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.158783  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2724  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  69.51 
 
 
88 aa  118  2e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181224  normal  0.753717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2817  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  69.51 
 
 
88 aa  118  2e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778336  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  69.51 
 
 
88 aa  119  2e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  69.51 
 
 
88 aa  118  2e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0510143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  69.14 
 
 
83 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6136  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  69.51 
 
 
88 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16437  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4349  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  72.37 
 
 
95 aa  117  4e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0134  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  67.07 
 
 
85 aa  116  8e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0826149  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03470  4Fe-4S ferredoxin  70.37 
 
 
83 aa  116  1e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0458605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3501  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  67.07 
 
 
90 aa  116  1e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.55262e-08 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1021  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  65.43 
 
 
85 aa  115  2e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1044  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  65.43 
 
 
85 aa  115  2e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  68.35 
 
 
83 aa  114  4e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5436  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  66.67 
 
 
87 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2757  iron-sulfur cluster-binding protein  66.67 
 
 
83 aa  113  9e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2376  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  66.67 
 
 
83 aa  113  9e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.0312838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3016  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  65.43 
 
 
85 aa  113  1e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3193  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  65.82 
 
 
83 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  65.82 
 
 
83 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3337  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  65.82 
 
 
83 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3513  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  65.43 
 
 
85 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1792  ferredoxin  69.62 
 
 
81 aa  111  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.190231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3199  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  65.82 
 
 
83 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0393  ferredoxin  69.62 
 
 
81 aa  111  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0879647  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1135  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  65.82 
 
 
83 aa  111  4e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  65.82 
 
 
83 aa  111  4e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1251  ferredoxin, 4Fe-4S  65.82 
 
 
83 aa  111  4e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1002  ferredoxin, 4Fe-4S  64.2 
 
 
83 aa  110  8e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2803  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  64.56 
 
 
83 aa  109  1e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2780  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  66.27 
 
 
86 aa  109  2e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  62.96 
 
 
85 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0460  ferredoxin, 4Fe-4S  64.63 
 
 
87 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2785  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  62.96 
 
 
85 aa  108  4e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.998826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1525  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  62.03 
 
 
85 aa  107  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.803833  normal  0.0618642 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3617  iron-sulfur cluster-binding protein  65.06 
 
 
86 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3664  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  62.65 
 
 
86 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1141  iron-sulfur cluster-binding protein  65.06 
 
 
86 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0250  ferredoxin  60.98 
 
 
84 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.575881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1073  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  62.65 
 
 
87 aa  104  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.509632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0208  ferredoxin  61.45 
 
 
86 aa  104  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1020  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  63.1 
 
 
85 aa  103  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.17542  normal  0.0132682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01023  hypothetical protein  60.98 
 
 
84 aa  103  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2467  ferredoxin  60.98 
 
 
84 aa  103  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3066  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  62.65 
 
 
86 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424966  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60 
 
 
85 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00927577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2715  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  60.24 
 
 
86 aa  101  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2847  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  60.24 
 
 
86 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448033  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2738  ferredoxin  60.24 
 
 
86 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2715  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  60.24 
 
 
94 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3797  4Fe-4S binding domain protein  60.24 
 
 
94 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.872793  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>