More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10083 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10083  oxidoreductase  100 
 
 
159 aa  312  1e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0168847  normal  0.111213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4470  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  67.97 
 
 
162 aa  206  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2984  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  72.44 
 
 
162 aa  186  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  7.99744e-05  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4702  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  66.67 
 
 
158 aa  166  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2465  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  58.73 
 
 
279 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.150245  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3850  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  59.17 
 
 
177 aa  145  2e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100692  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1265  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  54.11 
 
 
177 aa  145  2e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2479  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  56.69 
 
 
177 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.544782 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0796  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  54.76 
 
 
236 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0698  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  47.29 
 
 
173 aa  140  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.645243  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0934  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  61.95 
 
 
174 aa  140  1e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0713  hydrogenase-4 component I  44.9 
 
 
274 aa  139  1e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0121746  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2154  hydrogenase-4, I subunit  48.1 
 
 
165 aa  139  1e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.5376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1812  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  48.1 
 
 
165 aa  139  1e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.718239  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0125  hydrogenase-Ni,Fe-hydrogenase III small subunit  47.29 
 
 
271 aa  139  1e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1868  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  51.2 
 
 
274 aa  139  1e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0673  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.42 
 
 
146 aa  139  2e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1637  hypothetical protein  44.22 
 
 
274 aa  139  2e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0171  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  60.18 
 
 
170 aa  139  2e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0321  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  54.17 
 
 
173 aa  138  2e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4283  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  48.03 
 
 
155 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1137  hydrogenase subunit  48.48 
 
 
169 aa  138  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6070  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  53.97 
 
 
176 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4666  hydrogenase 4 subunit I  46.25 
 
 
171 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1686  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  51.59 
 
 
266 aa  135  3e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1302  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  46.46 
 
 
165 aa  134  7e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3287  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  46.88 
 
 
171 aa  133  1e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.576351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0921  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  52.5 
 
 
181 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1817  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  55.28 
 
 
170 aa  131  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1266  formate hydrogenlyase subunit 7  45.91 
 
 
174 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4568  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  51.64 
 
 
246 aa  130  8e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0324  putative hydrogenase/oxidoreductase subunit  53.85 
 
 
177 aa  130  8e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1316  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  51.67 
 
 
171 aa  129  2e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0174  putative hydrogenase/oxidoreductase subunit  52.99 
 
 
175 aa  129  2e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1401  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  57.39 
 
 
167 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1612  putative hydrogenase subunit  44.65 
 
 
172 aa  128  4e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2588  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  48.41 
 
 
145 aa  128  4e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1527  putative hydrogenase subunit  44.65 
 
 
172 aa  128  4e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3157  formate hydrogenlyase, subunit G  45 
 
 
255 aa  127  7e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102122 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2184  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  45 
 
 
252 aa  127  7e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.245512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3007  formate hydrogenlyase, subunit G  45 
 
 
255 aa  127  8e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1070  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.2 
 
 
142 aa  127  8e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2844  formate hydrogenlyase, subunit G  45 
 
 
255 aa  127  8e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0598328 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3050  formate hydrogenlyase subunit G  45 
 
 
255 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2968  formate hydrogenlyase, subunit G  45 
 
 
255 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02534  hypothetical protein  45 
 
 
255 aa  127  8e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0993  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  45 
 
 
255 aa  127  8e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0465314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2999  formate hydrogenlyase subunit G  45 
 
 
255 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0132689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02569  hydrogenase 3 and formate hydrogenase complex, HycG subunit  45 
 
 
255 aa  127  8e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3034  formate hydrogenlyase subunit G  45 
 
 
255 aa  127  8e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.79196e-05 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0970  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  45 
 
 
255 aa  127  8e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2855  formate hydrogenlyase, subunit G  45 
 
 
255 aa  127  8e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3970  formate hydrogenlyase, subunit G  45 
 
 
255 aa  127  8e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1278  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  50 
 
 
263 aa  126  1e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499713  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3192  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  44.29 
 
 
255 aa  126  1e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1570  hydrogenase, group 4, HycG subunit, putative  50.83 
 
 
171 aa  125  2e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000101329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2715  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  50 
 
 
263 aa  125  2e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01010  Ni,Fe-hydrogenase III small subunit  44.52 
 
 
283 aa  125  2e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0957  membrane bound hydrogenase subunit mbhJ  46.51 
 
 
143 aa  125  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0013552  normal  0.515096 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1448  hydrogenase, HycG subunit  50.83 
 
 
171 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  8.29996e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2428  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  50.83 
 
 
265 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0938  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  50 
 
 
246 aa  123  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.358765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02343  hypothetical protein  47.5 
 
 
252 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2771  hydrogenase-4, I subunit  48.33 
 
 
252 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2861  hydrogenase-4, I subunit  48.33 
 
 
252 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2623  hydrogenase-4, I subunit  47.5 
 
 
252 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02381  hydrogenase 4, Fe-S subunit  47.5 
 
 
252 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1180  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  48.33 
 
 
252 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0607  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  49.62 
 
 
264 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2636  hydrogenase-4, I subunit  48.33 
 
 
252 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1187  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  47.5 
 
 
252 aa  121  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.274215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3711  hydrogenase-4, I subunit  48.33 
 
 
252 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1671  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  39.24 
 
 
185 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1789  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  46.98 
 
 
274 aa  120  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1122  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  49.17 
 
 
172 aa  118  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.588826  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2503  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  49.11 
 
 
157 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1520  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  49.11 
 
 
157 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2596  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  48.41 
 
 
244 aa  118  4e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1084  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  45.53 
 
 
154 aa  117  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00491903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0745  NAD-dependent dehydrogenase subunit  47.62 
 
 
229 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.901132  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13360  ech hydrogenase subunit C  40 
 
 
146 aa  113  9e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2783  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  42.74 
 
 
179 aa  112  1e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2229  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  44.44 
 
 
183 aa  112  1e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0705013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0150  ech hydrogenase subunit C  43.86 
 
 
156 aa  113  1e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2791  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  42.74 
 
 
179 aa  112  1e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2726  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  41.46 
 
 
147 aa  112  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0851861  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0886  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  48.72 
 
 
263 aa  111  4e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0181  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  50.41 
 
 
245 aa  111  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.419402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2455  ech hydrogenase subunit C  42.74 
 
 
163 aa  110  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0152532  normal  0.126862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4116  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  43.8 
 
 
338 aa  110  7e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3660  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  45.74 
 
 
256 aa  110  7e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3801  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  44.96 
 
 
259 aa  110  8e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3429  hypothetical protein  43.42 
 
 
290 aa  110  1e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3718  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  44.96 
 
 
256 aa  110  1e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0184008  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3218  hypothetical protein  43.42 
 
 
290 aa  110  1e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325028  normal  0.252924 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0638  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  50.83 
 
 
164 aa  109  2e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00410575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2553  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  44.44 
 
 
252 aa  109  2e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0362  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  41.8 
 
 
160 aa  108  4e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.547425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3786  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  44.19 
 
 
256 aa  108  4e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.312558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1572  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  44.35 
 
 
147 aa  108  4e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.105543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>