20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2199 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2199  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2547  hypothetical protein  86.52 
 
 
178 aa  319  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44205  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29001  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  71.91 
 
 
178 aa  253  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1275  hypothetical protein  65.05 
 
 
195 aa  250  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140299  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21461  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  65.05 
 
 
195 aa  249  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.901505 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18031  hypothetical protein  70.25 
 
 
158 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18661  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  53.26 
 
 
206 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18661  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  52.98 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18851  4-hydroxybenzoate synthetase (chorismate lyase)  52.5 
 
 
167 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.801605  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1768  hypothetical protein  54.25 
 
 
166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150107  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0091  hypothetical protein  46.99 
 
 
203 aa  165  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0375  protein of unknown function DUF564  46.89 
 
 
201 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0515  hypothetical protein  47.73 
 
 
209 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228468  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3700  hypothetical protein  46.63 
 
 
208 aa  155  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1568  protein of unknown function DUF564  46.86 
 
 
203 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232035  hitchhiker  0.00190267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1289  protein of unknown function DUF564  44.32 
 
 
201 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1318  protein of unknown function DUF564  44.32 
 
 
201 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.542836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0050  hypothetical protein  44.89 
 
 
205 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40512  predicted protein  36.88 
 
 
247 aa  105  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143687  normal  0.760886 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35045  predicted protein  37.85 
 
 
214 aa  95.1  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.132422  normal  0.23655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>