11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2613 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2613    100 
 
 		 279 bp  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00896121  normal  0.224183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  87.01 
 
 		 1245 bp  73.8  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  92.16 
 
 		 1236 bp  69.9  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  84.93 
 
 		 1227 bp  58  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  96.77 
 
 		 1233 bp  54  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  85 
 
 		 1281 bp  48.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  82.89 
 
 		 1230 bp  48.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  82.89 
 
 		 1230 bp  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  83.33 
 
 		 1254 bp  48.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  86.27 
 
 		 1251 bp  46.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  86.27 
 
 		 1254 bp  46.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>