19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3113 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3113  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  100 
 
 		 238 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3341  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  88.24 
 
 		 238 aa  410  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6046  hypothetical protein  46.15 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0936816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5484  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  42.56 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000353718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5617  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  43.93 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  normal  0.170718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2523  hypothetical protein  42.54 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0056  hypothetical protein  49.32 
 
 		 180 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20680  hypothetical protein  39.29 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0485442  normal  0.374209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2994  hypothetical protein  41.39 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0023036  hitchhiker  0.000591455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3655  hypothetical protein  41.35 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0168589  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2050  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  36.04 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.909792  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0168  hypothetical protein  33.63 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1505  hypothetical protein  30.88 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0282  hypothetical protein  36.49 
 
 		 301 aa  82  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0282  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  33.47 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0024  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  34.38 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1455  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4508  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  33.33 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1506  hypothetical protein  30.7 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>