20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0927 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0927  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  323  6e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  5.34724e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02633  hypothetical protein  43.15 
 
 
180 aa  139  2e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  42.21 
 
 
160 aa  136  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2080  hypothetical protein  45.26 
 
 
158 aa  121  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61450  hypothetical protein  36 
 
 
157 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.428854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5293  hypothetical protein  35.33 
 
 
157 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  43.41 
 
 
169 aa  110  7e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  41.38 
 
 
159 aa  110  8e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  36.84 
 
 
154 aa  109  1e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  37.84 
 
 
154 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  37.24 
 
 
156 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  33.76 
 
 
159 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  38.46 
 
 
165 aa  98.2  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  35.04 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0034  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  31.65 
 
 
157 aa  81.6  3e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5656  hypothetical protein  27.86 
 
 
167 aa  77  8e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  31.39 
 
 
157 aa  76.6  1e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>