15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3883 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3883  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  497  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4167  hypothetical protein  51.43 
 
 
350 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2184  hypothetical protein  37.99 
 
 
329 aa  85.5  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0960241  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0619  hypothetical protein  45.1 
 
 
135 aa  72  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2366  hypothetical protein  50.82 
 
 
66 aa  62  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.251457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0942  hypothetical protein  42.16 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.187619  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0943  hypothetical protein  42.19 
 
 
67 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.351924  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2645  phage immunity repressor protein  49.09 
 
 
131 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000108991 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0377  phage immunity repressor protein  38.46 
 
 
58 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.114796  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4779  phage immunity repressor protein  38.46 
 
 
58 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0047  putative bacteriophage protein  43.64 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1057  putative bacteriophage protein  43.64 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4007  phage protein  43.64 
 
 
134 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0618  hypothetical protein  38.89 
 
 
210 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3107  putative CI repressor  36.62 
 
 
183 aa  41.6  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.505611  normal  0.201687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>