33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3258 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3258  DNA-binding transcriptional activator OsmE  100 
 
 		 109 aa  224  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000131774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1961  DNA-binding transcriptional activator OsmE  55.34 
 
 		 109 aa  139  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0641775  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2192  DNA-binding transcriptional activator OsmE  58.72 
 
 		 110 aa  137  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1899  DNA-binding transcriptional activator OsmE  57.8 
 
 		 110 aa  136  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2033  DNA-binding transcriptional activator OsmE  56.48 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1860  DNA-binding transcriptional activator OsmE  56.48 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1408  DNA-binding transcriptional activator OsmE  56.48 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0962519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1440  DNA-binding transcriptional activator OsmE  56.48 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1425  DNA-binding transcriptional activator OsmE  56.48 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353407  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1903  SmpA/OmlA domain protein  52.29 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00378  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01696  hypothetical protein  52.29 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2457  DNA-binding transcriptional activator OsmE  52.29 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.656283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1983  DNA-binding transcriptional activator OsmE  52.29 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1452  DNA-binding transcriptional activator OsmE  52.29 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1893  DNA-binding transcriptional activator OsmE  52.29 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425463  normal  0.134646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01708  DNA-binding transcriptional activator  52.29 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1960  DNA-binding transcriptional activator OsmE  52.29 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1821  DNA-binding transcriptional activator OsmE  52.29 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1705  DNA-binding transcriptional activator OsmE  55.56 
 
 		 114 aa  130  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2042  DNA-binding transcriptional activator OsmE  52.29 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00150637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4903  osmotically-inducible lipoprotein OsmE, putative  43.81 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4446  DNA-binding transcriptional activator OsmE  42.86 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4912  DNA-binding transcriptional activator OsmE  49.32 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000854262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4733  DNA-binding transcriptional activator OsmE  43.14 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5598  DNA-binding transcriptional activator OsmE  36.19 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64480  DNA-binding transcriptional activator OsmE  35.24 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4647  DNA-binding transcriptional activator OsmE  42.16 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0548211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4855  DNA-binding transcriptional activator OsmE  47.95 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0118747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2158  DNA-binding transcriptional activator OsmE  38.64 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0215462  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2823  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.75 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302123  normal  0.242742 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3242  hypothetical protein  26.47 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819475  normal  0.751832 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2300  osmotically-inducible lipoprotein OsmE  27.68 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4320  hypothetical protein  26.96 
 
 		 123 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111095  normal  0.277826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>