72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2113 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2113  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  100 
 
 		 66 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.110001  normal  0.234091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2012  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  100 
 
 		 66 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000291515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1963  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  90.91 
 
 		 65 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2358  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  88.06 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4493  hypothetical protein  72.86 
 
 		 71 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2207  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  72.86 
 
 		 71 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2220  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  72.86 
 
 		 71 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000072597  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2164  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  72.86 
 
 		 71 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.123278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2214  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  72.86 
 
 		 71 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365447  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1953  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  65.43 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2016  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  78.33 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1845  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  82.46 
 
 		 89 aa  92  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2419  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  82.69 
 
 		 64 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00562529  hitchhiker  0.0000013889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2217  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  85.45 
 
 		 61 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1991  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  72.13 
 
 		 61 aa  87  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2220  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  63.77 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.482957  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1797  hypothetical protein  64.52 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275995  normal  0.177533 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0933  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  76 
 
 		 70 aa  80.1  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177633  normal  0.669398 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2067  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  63.33 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02297  hypothetical protein  55.77 
 
 		 54 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1569  cytochrome oxidase maturation protein (cbb3-t)  65.22 
 
 		 56 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.246942  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2415  secretion protein HlyD  50 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003473  type cbb3 cytochrome oxidase biogenesis protein CcoS involved in heme b insertion  58.7 
 
 		 54 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1047  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  56.52 
 
 		 54 aa  62.8  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.372201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1815  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  47.14 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02061  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  71.74 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3580  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.06 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1995  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.62 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.407314  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0165  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.39 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2611  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.9 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38073  normal  0.51835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3827  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  53.33 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  37.1 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1606  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  53.33 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0765964  normal  0.010544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4262  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  53.33 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1874  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.39 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.308145  normal  0.762783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1791  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.94 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1364  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  37.93 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.540828 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19940  cbb3-type cytochrome oxidase maturation protein  38.98 
 
 		 73 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225111  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0452  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 		 58 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0935391  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5919  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.55 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.662161 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1989  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.65 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.552056  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1156  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  32.81 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.0826721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0668  nitrogen fixation protein fixS  44.23 
 
 		 52 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44450  hypothetical protein  55.56 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00324047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3784  hypothetical protein  55.56 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376969  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2042  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  36.96 
 
 		 48 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.589343  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1052  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  33.82 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2045  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.96 
 
 		 48 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00305022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0712  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  35.48 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720002  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3323  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  39.34 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0243934  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2571  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.75 
 
 		 49 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.831521  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0462  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42 
 
 		 52 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1275  signal peptide protein  35.59 
 
 		 58 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2483  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.66 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0591918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1276  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  30.16 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5928  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.33 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.657419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1103  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  41.3 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0784477  normal  0.590624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1196  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  41.3 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2359  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  31.03 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2256  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.96 
 
 		 56 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0217106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0541  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.46 
 
 		 52 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2394  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  38 
 
 		 49 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0772  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.69 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4955  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.73 
 
 		 52 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000981596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1525  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  41.86 
 
 		 55 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5023  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34 
 
 		 52 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0946  hypothetical protein  36.96 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1472  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.96 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0256438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1795  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  41.3 
 
 		 49 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2344  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.62 
 
 		 52 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.005747  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0689  RdxS, cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.62 
 
 		 52 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2774  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  37.78 
 
 		 55 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.567495  normal  0.737222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>