15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1077 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1077  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1173  hypothetical protein  42.02 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1137  hypothetical protein  41.8 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000411653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1207  hypothetical protein  41.8 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000945215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1268  hypothetical protein  37.7 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1269  hypothetical protein  40.16 
 
 		 123 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000458389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1225  hypothetical protein  39.34 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000155857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1302  hypothetical protein  40.16 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000316853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3088  hypothetical protein  39.34 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000343342  hitchhiker  0.00665202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3418  hypothetical protein  38.52 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1136  hypothetical protein  40.16 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000147263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2908  hypothetical protein  35.83 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.553856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0903  hypothetical protein  37.9 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.595758  normal  0.717815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2742  hypothetical protein  35.25 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.448875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1064  hypothetical protein  37.33 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>