32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1255 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 209 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  71.01 
 
 		 215 aa  323  9e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  70.53 
 
 		 215 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  70.53 
 
 		 215 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  70.53 
 
 		 215 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  70.87 
 
 		 212 aa  318  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  70.24 
 
 		 215 aa  317  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  68.6 
 
 		 212 aa  315  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  68.6 
 
 		 212 aa  314  7e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  68.12 
 
 		 212 aa  313  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  68.12 
 
 		 212 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  67.15 
 
 		 212 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  68.29 
 
 		 215 aa  304  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000278112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  66.99 
 
 		 212 aa  300  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  68 
 
 		 216 aa  297  6e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  63.94 
 
 		 213 aa  292  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  44 
 
 		 214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  42.57 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  41.29 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  33.97 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  31.75 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  31.38 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  32.12 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  31.61 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  31.05 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  29.9 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  27.37 
 
 		 210 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  27.51 
 
 		 237 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33057  predicted protein  36.51 
 
 		 447 aa  42.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>