16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0089 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0089  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  357  4e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0292  hypothetical protein  46.15 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0285  hypothetical protein  45.56 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0293  hypothetical protein  45.56 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0297  hypothetical protein  45.56 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4429  hypothetical protein  45.56 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0281  hypothetical protein  45.56 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000237407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0396  hypothetical protein  46.15 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0280  hypothetical protein  45.56 
 
 		 173 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3741  hypothetical protein  45.56 
 
 		 173 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0108  hypothetical protein  46.47 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000003316  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4111  hypothetical protein  39.88 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0096  hypothetical protein  40.45 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000129427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4393  hypothetical protein  39.33 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000355578  hitchhiker  0.0000221943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3533  hypothetical protein  38.15 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4784  hypothetical protein  35.39 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000553025  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>