More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2554 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1300  hypothetical protein  100 
 
 
147 bp  155  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00987773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2546  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0594848  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3626  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00292958  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2775  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.466623  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2555  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000235232  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2554  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2646  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177514  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2645  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0670079  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4679  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.70415e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2969  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0013859  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2670  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2776  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.453071  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2603  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323459  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2604  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0335338  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2669  tRNA-Ala  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00260551  hitchhiker  0.00377232 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0041  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00270764  hitchhiker  0.00379847 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2968  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00156309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0062  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3627  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00311856  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0056  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0181776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0060  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00115408  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4597  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0014  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  1.83317e-10  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0029  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  6.36082e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0032  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  4.39194e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2547  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.03374  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0059  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0030  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  6.20846e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000491618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5048  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.23557e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  7.42006e-05  normal  0.411264 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21974  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138749  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1301  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00804048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04531  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  1.51858e-06  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_003295  RS04529  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  9.42406e-09  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4680  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.67016e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00550972  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.63432e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0035  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.7464e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0038  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000499676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0064  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.478576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0062  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0060  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0168409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00040  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  2.2346e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0027  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  1.68426e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00039  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  2.21447e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0041  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148903  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5047  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.62268e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2008  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0187  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  145  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0056  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  3.05477e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0029  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0737058 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3211  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  5.14426e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0031  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0725806 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0058  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  3.57472e-13  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0018  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.867463  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0040  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570162  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0033  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.106425 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2102  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  1.04727e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2101  hypothetical protein  97.37 
 
 
228 bp  135  2e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  2.10975e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0053  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2486  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  3.14441e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0053  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0051  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0049  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.661163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0049  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.123188  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0051  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118722  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0075  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0028  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  5.4137e-15  normal  0.608945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0071  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0073  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0027  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0047  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.055133  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1375  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  1.9852e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2540  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  8.14865e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2459  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0021  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000859233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0016  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320664  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0035  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222164  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0048  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0051  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.697724  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1985  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  5.6627e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0029  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0993455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0022  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R34  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0041  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2626  hypothetical protein  97.37 
 
 
1470 bp  135  2e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  1.64664e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2625  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  2.51255e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0044  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0044  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  3.54338e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0045  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  2.05649e-14  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0092  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  4.31101e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0098  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.10088e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0093  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.0191e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0058  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  6.13252e-13  normal  0.244453 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0027  tRNA-Ala  97.37 
 
 
76 bp  135  2e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260032  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>