17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0077 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0077  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  243  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2527  hypothetical protein  58.27 
 
 
127 aa  147  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2005  hypothetical protein  54.33 
 
 
127 aa  140  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.209135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0499  hypothetical protein  55.91 
 
 
127 aa  138  2e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.455991 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2286  hypothetical protein  55.12 
 
 
127 aa  139  2e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2070  hypothetical protein  56 
 
 
122 aa  137  5e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.901596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2251  hypothetical protein  55.12 
 
 
128 aa  137  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  6.28471e-07  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1435  hypothetical protein  55.12 
 
 
128 aa  135  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2357  hypothetical protein  51.97 
 
 
127 aa  129  2e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03230  hypothetical protein  43.65 
 
 
128 aa  117  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.756672  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1046  hypothetical protein  38.4 
 
 
113 aa  71.6  3e-12  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0709  hypothetical protein  34.4 
 
 
112 aa  57  8e-08  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.524327  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0730  hypothetical protein  35.48 
 
 
112 aa  56.2  1e-07  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.506289  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0474  hypothetical protein  33.06 
 
 
113 aa  56.6  1e-07  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0073  MacA  34.4 
 
 
112 aa  56.2  2e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2679  hypothetical protein  35.59 
 
 
116 aa  55.8  2e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.34028e-06  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1573  hypothetical protein  38.98 
 
 
112 aa  53.1  1e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>