17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0730 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0730  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  218  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.506289  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0709  hypothetical protein  75 
 
 
112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.524327  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0073  MacA  75.89 
 
 
112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1046  hypothetical protein  71.43 
 
 
113 aa  159  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1573  hypothetical protein  63.39 
 
 
112 aa  142  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0474  hypothetical protein  58.41 
 
 
113 aa  137  6e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2679  hypothetical protein  42.86 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000134028  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2286  hypothetical protein  38.89 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2527  hypothetical protein  38.89 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2070  hypothetical protein  38.02 
 
 
122 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.901596 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0077  hypothetical protein  35.48 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03230  hypothetical protein  32.81 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.756672  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2357  hypothetical protein  32.54 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2251  hypothetical protein  38.02 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2005  hypothetical protein  34.96 
 
 
127 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.209135  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1435  hypothetical protein  34.71 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0499  hypothetical protein  36.22 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.455991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>