17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2286 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2286  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  245  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2527  hypothetical protein  86.61 
 
 
127 aa  214  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1435  hypothetical protein  64.57 
 
 
128 aa  165  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2005  hypothetical protein  66.14 
 
 
127 aa  165  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.209135  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2357  hypothetical protein  63.78 
 
 
127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2251  hypothetical protein  66.14 
 
 
128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0499  hypothetical protein  66.14 
 
 
127 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.455991 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2070  hypothetical protein  62.2 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.901596 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0077  hypothetical protein  55.12 
 
 
125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03230  hypothetical protein  60 
 
 
128 aa  136  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.756672  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1046  hypothetical protein  40.32 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2679  hypothetical protein  40.35 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000134028  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1573  hypothetical protein  42.74 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0730  hypothetical protein  38.89 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.506289  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0073  MacA  37.8 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0474  hypothetical protein  36.51 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0709  hypothetical protein  36.22 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.524327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>