11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0898 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0898  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  32.39 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4230  hypothetical protein  27.68 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318595  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0912  membrane protein  34.41 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  30.99 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2991  membrane protein-like protein  31.73 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  39.39 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  32.98 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  32.98 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1245  hypothetical protein  30.63 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000160953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4074  hypothetical protein  31.91 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>