60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0490 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0487  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.687e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3853  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000215717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0466  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  7.39571e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0490  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  9.00641e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0542  hypothetical protein  95.65 
 
 
70 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0502225  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3681  hypothetical protein  94.2 
 
 
70 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0122929  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3506  hypothetical protein  94.2 
 
 
70 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00012483  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4134  hypothetical protein  94.2 
 
 
70 aa  134  3e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0446  hypothetical protein  91.3 
 
 
70 aa  132  2e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00475096  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0459  hypothetical protein  75 
 
 
71 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3391  hypothetical protein  65.71 
 
 
71 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.97352e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0411  hypothetical protein  64.29 
 
 
71 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0459  hypothetical protein  63.24 
 
 
73 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3404  hypothetical protein  60 
 
 
73 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4510  hypothetical protein  60.29 
 
 
73 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  52.24 
 
 
72 aa  76.6  1e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  51.47 
 
 
71 aa  73.6  8e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  52.24 
 
 
72 aa  72.8  2e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  48.53 
 
 
70 aa  70.9  5e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  50.75 
 
 
73 aa  70.1  9e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  46.97 
 
 
73 aa  68.6  3e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2120  hypothetical protein  52.24 
 
 
75 aa  66.2  1e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  47.76 
 
 
71 aa  63.5  9e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2236  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  62.4  2e-09  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01394  hypothetical protein  44.78 
 
 
74 aa  60.8  7e-09  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2221  protein of unknown function DUF465  44.78 
 
 
74 aa  60.8  7e-09  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.322461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2234  hypothetical protein  44.78 
 
 
74 aa  60.8  7e-09  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.282383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01383  hypothetical protein  44.78 
 
 
74 aa  60.8  7e-09  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1604  hypothetical protein  44.78 
 
 
74 aa  60.8  7e-09  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1507  hypothetical protein  44.78 
 
 
74 aa  60.8  7e-09  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1749  hypothetical protein  44.78 
 
 
74 aa  60.8  7e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.297536  hitchhiker  6.33641e-19 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1490  hypothetical protein  44.93 
 
 
71 aa  59.7  1e-08  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1650  hypothetical protein  44.78 
 
 
74 aa  59.7  1e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0499  hypothetical protein  44.93 
 
 
71 aa  59.3  2e-08  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.132623  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2030  hypothetical protein  44.78 
 
 
74 aa  59.3  2e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171486  hitchhiker  4.87786e-14 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  43.28 
 
 
73 aa  58.9  2e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0474  hypothetical protein  44.93 
 
 
71 aa  59.3  2e-08  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366542  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2075  hypothetical protein  40.3 
 
 
82 aa  57  8e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0910666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1796  hypothetical protein  40.3 
 
 
82 aa  56.6  1e-07  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.256356  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1438  hypothetical protein  35.82 
 
 
78 aa  51.6  3e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119684  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1761  hypothetical protein  35.82 
 
 
78 aa  51.6  3e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0709  hypothetical protein  50.75 
 
 
72 aa  51.6  4e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0906  hypothetical protein  42.03 
 
 
78 aa  50.1  1e-05  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  33.85 
 
 
88 aa  48.5  3e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.72034e-14  hitchhiker  9.1308e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  37.68 
 
 
86 aa  48.1  4e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1031  conserved hypothetical protein (DUF465 domain protein)  41.43 
 
 
71 aa  47.8  5e-05  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0974  hypothetical protein  40.91 
 
 
75 aa  47.8  5e-05  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  39.68 
 
 
81 aa  47.8  6e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  36.76 
 
 
81 aa  47  8e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  35.82 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  32.39 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  34.29 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  31.82 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  28.36 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  36.76 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  30.77 
 
 
78 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1610  protein of unknown function DUF465  45.95 
 
 
75 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  32.31 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  33.85 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>