12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4078 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4078  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  548  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0047  putative bacteriophage protein  38.69 
 
 		 196 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1057  putative bacteriophage protein  38.69 
 
 		 196 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0691  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  72  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000499925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3107  putative CI repressor  38.22 
 
 		 183 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.505611  normal  0.201687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  96.67 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2306  hypothetical protein  90.32 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4007  phage protein  42.06 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2645  phage immunity repressor protein  36.54 
 
 		 131 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000108991 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  35 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0317  protein ash  37.74 
 
 		 110 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.387224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2961  phage immunity repressor protein  47.37 
 
 		 64 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  hitchhiker  0.00000287502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>