16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4816 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4816  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.536398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4367  hypothetical protein  78.29 
 
 		 304 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5663  hypothetical protein  32.46 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570228  normal  0.031893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5416  hypothetical protein  32.27 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5035  hypothetical protein  31.82 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5123  hypothetical protein  31.82 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1144  hypothetical protein  33.03 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437754  normal  0.0600359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4368  hypothetical protein  30.74 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4817  hypothetical protein  32.31 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13873  hypothetical protein  30.99 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2657  hypothetical protein  33.6 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00775221  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0142  hypothetical protein  31.98 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01020  hypothetical protein  30.51 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5476  hypothetical protein  30.73 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0174  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0086  hypothetical protein  25.38 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>