19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3341 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3341  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  100 
 
 
238 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3113  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  88.24 
 
 
238 aa  410  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6046  hypothetical protein  46.96 
 
 
270 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0936816  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5617  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  44.77 
 
 
256 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  normal  0.170718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5484  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  42.15 
 
 
239 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000353718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0056  hypothetical protein  51.35 
 
 
180 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2994  hypothetical protein  40.65 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0023036  hitchhiker  0.000591455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2523  hypothetical protein  42.11 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20680  hypothetical protein  39.73 
 
 
258 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0485442  normal  0.374209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3655  hypothetical protein  38.94 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0168589  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2050  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  35.14 
 
 
272 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.909792  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0168  hypothetical protein  34.65 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0024  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  40.29 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0282  hypothetical protein  38.65 
 
 
301 aa  79  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1505  hypothetical protein  30.41 
 
 
248 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1506  hypothetical protein  31.37 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4508  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  33.33 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0282  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  40.91 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1455  hypothetical protein  32.77 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>