40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1534 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1534  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 
203 aa  390  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000213303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0090  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.04 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227988  normal  0.252414 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0106  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.2 
 
 
226 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0095  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.2 
 
 
226 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0088  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.2 
 
 
228 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3092  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.4 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0120702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  20.32 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.58 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1935  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.95 
 
 
212 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.707119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  20.21 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1364  hypothetical protein  26.83 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  20.65 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.17 
 
 
223 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0524  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.47 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  19.51 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.455724  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0795  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.84 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2758  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141444  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0706  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.84 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2459  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.68 
 
 
213 aa  45.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00395649  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.99 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.88 
 
 
230 aa  45.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  22.88 
 
 
230 aa  45.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06126  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.8 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.53 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01040  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.8 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.17 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  27.17 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  18.81 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3207  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.58 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0138209  hitchhiker  0.00000000000000265971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0718  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.76 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1160  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.3 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0682728 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1121  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.16 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.310503  normal  0.176319 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.57 
 
 
205 aa  42  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0691  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.55 
 
 
227 aa  42  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.947793  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  29.21 
 
 
193 aa  41.6  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1026  outer-membrane lipoprotein carrier protein  20.59 
 
 
203 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0966  outer-membrane lipoprotein carrier protein  20.59 
 
 
203 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0187172  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1075  outer-membrane lipoprotein carrier protein  20.59 
 
 
203 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1060  outer-membrane lipoprotein carrier protein  20.59 
 
 
203 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0995  outer-membrane lipoprotein carrier protein  20.59 
 
 
203 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>