15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0716 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0716  monoheme cytochrome c, putative  100 
 
 		 127 aa  268  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0008  monoheme cytochrome c, putative  76.61 
 
 		 127 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0008  monoheme cytochrome c, putative  84.21 
 
 		 127 aa  200  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0008  monoheme cytochrome c, putative  78.51 
 
 		 127 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000351615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0980  hypothetical protein  67.33 
 
 		 129 aa  163  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00330636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1174  hypothetical protein  55.37 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3623  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2873  hypothetical protein  42.11 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0030  hypothetical protein  36.45 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.593403  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0004  hypothetical protein  35.51 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408251  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0008  hypothetical protein  40.57 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6938  hypothetical protein  40.7 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3243  hypothetical protein  32.29 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984975  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2982  hypothetical protein  34.85 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5266  hypothetical protein  36.51 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.536404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>