33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1074 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1074  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  652    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1604  hypothetical protein  76.92 
 
 
326 aa  509  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.966783  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1572  hypothetical protein  76.92 
 
 
326 aa  509  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2846  hypothetical protein  34.82 
 
 
322 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.701661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3990  hypothetical protein  35.14 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2288  protein of unknown function DUF939  35.03 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4056  hypothetical protein  34.82 
 
 
322 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4171  hypothetical protein  34.82 
 
 
322 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.781105 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4373  hypothetical protein  34.82 
 
 
322 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0189837  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3902  hypothetical protein  34.82 
 
 
322 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00608095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4282  hypothetical protein  34.5 
 
 
322 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000114221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0974  hypothetical protein  34.5 
 
 
322 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00289539  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4261  hypothetical protein  34.5 
 
 
322 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0114239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3895  hypothetical protein  34.19 
 
 
322 aa  215  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000792929  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4222  hypothetical protein  33.87 
 
 
322 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0303  protein of unknown function DUF939  35.99 
 
 
324 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1527  hypothetical protein  32.15 
 
 
316 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1808  hypothetical protein  32.15 
 
 
316 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0309492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0384  hypothetical protein  26.45 
 
 
326 aa  109  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1121  protein of unknown function DUF939  27.51 
 
 
319 aa  92.8  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000198166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0512  putative lipoprotein  23.91 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0584  putative lipoprotein  23.91 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0585  putative lipoprotein  23.91 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0529  putative lipoprotein  23.91 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0436  hypothetical protein  23.91 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0468809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0440  hypothetical protein  23.91 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0497  putative lipoprotein  23.91 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0445  hypothetical protein  23.53 
 
 
381 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0533  putative lipoprotein  23.37 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0945445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4792  putative lipoprotein  23.37 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591787  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2854  protein of unknown function DUF939  22.37 
 
 
390 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  21.23 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0451  hypothetical protein  22.83 
 
 
394 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>