14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0064 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0064  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7608  hypothetical protein  26.59 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2275  hypothetical protein  30.17 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.137375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1772  hypothetical protein  28.7 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.077291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1591  hypothetical protein  28.7 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1616  hypothetical protein  28.7 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3776  hypothetical protein  31.34 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4616  hypothetical protein  31.34 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3480  hypothetical protein  25.33 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0884428  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3747  hypothetical protein  31.34 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7021  hypothetical protein  25.96 
 
 
284 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617081  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2253  hypothetical protein  24.3 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3915  hypothetical protein  25 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206189  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2249  hypothetical protein  27.23 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>