17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4136 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4136  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1460  hypothetical protein  89.05 
 
 		 141 aa  233  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.355787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0508  hypothetical protein  35.77 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3243  hypothetical protein  32.84 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00128168  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0030  hypothetical protein  28.89 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0009915  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0587  hypothetical protein  31.62 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1545  hypothetical protein  36.51 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2670  hypothetical protein  31.01 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4859  hypothetical protein  30.61 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3347  hypothetical protein  28.79 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.184685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3406  hypothetical protein  31.06 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.088812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0144  hypothetical protein  31.58 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6457  hypothetical protein  30.56 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0286  hypothetical protein  27.82 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0286  hypothetical protein  27.82 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.81964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33921  predicted protein  25 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8856  predicted protein  27.08 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.198885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>