11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2066 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2066  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  980    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.380444  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17430  hypothetical protein  68 
 
 		 480 aa  677    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2993  hypothetical protein  61.22 
 
 		 481 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4205  hypothetical protein  57.77 
 
 		 478 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1615  hypothetical protein  30.53 
 
 		 506 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.925235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0702  hypothetical protein  27.78 
 
 		 500 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.166021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  25.68 
 
 		 902 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2171  hypothetical protein  27.27 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.26529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2172  hypothetical protein  25.97 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.517611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  23.18 
 
 		 888 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  21.97 
 
 		 894 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.490133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>