18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0020 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0020  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  212  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.681343  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1571  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000356079  normal  0.0472602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1799  hypothetical protein  39.13 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0441  hypothetical protein  40.82 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.423124  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1360  hypothetical protein  41 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3911  hypothetical protein  39.53 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3963  hypothetical protein  39.53 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0613138  hitchhiker  0.000789455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0955  hypothetical protein  37 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0329499 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0510  hypothetical protein  32.32 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.012362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0631  hypothetical protein  37.25 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.207272  normal  0.0397506 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1426  hypothetical protein  35.23 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2645  hypothetical protein  35.96 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.893359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2464  hypothetical protein  31.52 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000185704  hitchhiker  0.00000000555702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3811  hypothetical protein  27.08 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3862  hypothetical protein  27.08 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404726  normal  0.96775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3092  hypothetical protein  39.24 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3219  hypothetical protein  45.45 
 
 
51 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.302126 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0997  hypothetical protein  26.6 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.356148  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>