More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3409 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3409  septum site-determining protein MinD  100 
 
 
270 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224611  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  96.67 
 
 
270 aa  518  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  77.27 
 
 
266 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3422  septum site-determining protein MinD  72.83 
 
 
266 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00479465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0542  septum site-determining protein MinD  68.82 
 
 
263 aa  355  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000432714  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4346  septum site-determining protein MinD  64.39 
 
 
264 aa  347  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000124781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  62.88 
 
 
264 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  61.98 
 
 
266 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000107586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2129  septum site-determining protein MinD  63.6 
 
 
265 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000239479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3334  septum site-determining protein MinD  62.88 
 
 
264 aa  334  7e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0234044  normal  0.602718 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  64.84 
 
 
266 aa  334  9e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  62.74 
 
 
264 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  67.05 
 
 
266 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  63.18 
 
 
260 aa  330  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  65.87 
 
 
265 aa  329  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0520  septum site-determining protein MinD  58.94 
 
 
265 aa  325  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2558  septum site-determining protein MinD  63.64 
 
 
266 aa  323  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  62.21 
 
 
265 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  58.8 
 
 
267 aa  314  8e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  59.55 
 
 
267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1820  septum site-determining protein MinD  58.85 
 
 
266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  57.74 
 
 
265 aa  310  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4528  septum site-determining protein MinD  57.74 
 
 
265 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  57.74 
 
 
265 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  57.74 
 
 
265 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  57.74 
 
 
265 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4193  septum site-determining protein; cell division inhibitor  57.74 
 
 
265 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4582  septum site-determining protein MinD  57.74 
 
 
265 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  57.74 
 
 
265 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  57.74 
 
 
265 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  57.74 
 
 
265 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  57.36 
 
 
265 aa  306  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  57.53 
 
 
260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  58.82 
 
 
263 aa  301  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  54.96 
 
 
265 aa  296  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  54.96 
 
 
265 aa  296  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  55.65 
 
 
273 aa  295  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1461  septum site-determining protein MinD  59.02 
 
 
266 aa  295  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63007  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0932  septum site-determining protein MinD  57.36 
 
 
267 aa  293  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.602666 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1552  septum site-determining protein MinD  55.89 
 
 
267 aa  288  9e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0376  septum site-determining protein MinD  56.65 
 
 
266 aa  285  4e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3383  septum site-determining protein MinD  61.11 
 
 
268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  52.31 
 
 
264 aa  280  1e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0896  septum site-determining protein MinD  59.85 
 
 
268 aa  280  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.015324  hitchhiker  0.00397046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3349  septum site-determining protein MinD  59.18 
 
 
265 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2768  septum site-determining protein MinD  59.18 
 
 
265 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  53.73 
 
 
269 aa  277  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1993  septum site-determining protein MinD  61.66 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3019  septum site-determining protein MinD  59.84 
 
 
266 aa  268  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  50.94 
 
 
267 aa  268  5e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3478  septum site-determining protein MinD  62.55 
 
 
268 aa  268  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144531  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  50.55 
 
 
271 aa  268  8e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1399  septum site-determining protein MinD  56.76 
 
 
264 aa  268  8.999999999999999e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000334804  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  50.55 
 
 
274 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1259  septum site-determining protein MinD  58.3 
 
 
266 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130783  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  47.19 
 
 
269 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0944  septum site-determining protein MinD  49.63 
 
 
271 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0984  septum site-determining protein MinD  49.63 
 
 
271 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2415  septum site-determining protein MinD  49.63 
 
 
271 aa  255  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0505  septum site-determining protein MinD  49.26 
 
 
271 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.978735  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0856  septum site-determining protein MinD  49.63 
 
 
271 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.866875  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1689  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  48.13 
 
 
276 aa  254  7e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1688  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  48.13 
 
 
276 aa  254  7e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0844  septum site-determining protein MinD  49.63 
 
 
271 aa  254  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2174  septum site-determining protein MinD  47.58 
 
 
269 aa  254  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000643693  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2251  septum site-determining protein MinD  47.58 
 
 
269 aa  254  8e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000178028  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3026  septum site-determining protein MinD  48.13 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2577  septum site-determining protein MinD  46.84 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1881  cell division inhibitor MinD  46.64 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  46.84 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000153952  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2967  septum site-determining protein MinD  48.89 
 
 
271 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0322  septum site-determining protein MinD  49.81 
 
 
271 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0928879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2112  septum site-determining protein MinD  48.89 
 
 
271 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300985  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3066  septum site-determining protein MinD  48.89 
 
 
271 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3032  septum site-determining protein MinD  48.89 
 
 
271 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31894  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22020  cell division inhibitor MinD  46.64 
 
 
271 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0588924  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2632  septum site-determining protein MinD  48.89 
 
 
271 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1980  septum site-determining protein MinD  48.89 
 
 
271 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.618942  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2185  septum site-determining protein MinD  47.21 
 
 
269 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000542736  unclonable  0.00000174808 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0800  septum site-determining protein MinD  48.89 
 
 
271 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4088  septum site-determining protein MinD  48.89 
 
 
271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210489  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2971  septum site-determining protein MinD  49.06 
 
 
271 aa  252  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2520  septum site-determining protein MinD  46.47 
 
 
269 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147543  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  46.84 
 
 
269 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000128974  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1867  septum site-determining protein MinD  46.47 
 
 
269 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000037885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1901  septum site-determining protein MinD  46.47 
 
 
269 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000001062  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1894  septum site-determining protein MinD  46.47 
 
 
269 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000304586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2425  septum site-determining protein MinD  46.47 
 
 
269 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000184306  normal  0.063488 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  47.78 
 
 
270 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0276  septum site-determining protein MinD  45.56 
 
 
271 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2035  septum site-determining protein MinD  47.76 
 
 
270 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1764  septum site-determining protein MinD  46.1 
 
 
269 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  47.58 
 
 
271 aa  250  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2473  septum site-determining protein MinD  47.41 
 
 
270 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1319  cell division inhibitor MinD  47.41 
 
 
270 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000102659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2450  cell division inhibitor MinD  47.41 
 
 
270 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00994868  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1328  cell division inhibitor MinD  47.41 
 
 
270 aa  249  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000634164  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1570  septum site-determining protein MinD  47.78 
 
 
271 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1660  cell division inhibitor MinD  47.41 
 
 
270 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2757  cell division inhibitor MinD  48.15 
 
 
270 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000621875  hitchhiker  0.001596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>