269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0350 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  100 
 
 		 159 aa  324  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  91.19 
 
 		 159 aa  301  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  91.19 
 
 		 159 aa  301  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  83.33 
 
 		 159 aa  267  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  83.33 
 
 		 159 aa  266  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  77.22 
 
 		 158 aa  256  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  77.85 
 
 		 224 aa  254  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  77.27 
 
 		 159 aa  253  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  77.92 
 
 		 159 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  77.22 
 
 		 180 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  77.22 
 
 		 158 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  77.22 
 
 		 158 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  77.22 
 
 		 158 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  77.22 
 
 		 158 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  77.22 
 
 		 158 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  77.22 
 
 		 158 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  76.58 
 
 		 158 aa  249  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  75.32 
 
 		 158 aa  248  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  75.97 
 
 		 158 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  75.97 
 
 		 158 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  75.97 
 
 		 158 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  75.95 
 
 		 158 aa  246  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  75.32 
 
 		 158 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  73.42 
 
 		 158 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  75.66 
 
 		 159 aa  240  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  73.38 
 
 		 158 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  72.08 
 
 		 158 aa  232  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  70.78 
 
 		 158 aa  230  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  71.43 
 
 		 158 aa  229  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  70.25 
 
 		 158 aa  229  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  70.13 
 
 		 158 aa  229  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  70.13 
 
 		 158 aa  229  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  69.48 
 
 		 158 aa  228  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  71.15 
 
 		 159 aa  228  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  72.26 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  70.13 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  71.61 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  69.28 
 
 		 158 aa  224  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  72.08 
 
 		 158 aa  224  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  72.08 
 
 		 158 aa  224  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2557  bacterioferritin  68.83 
 
 		 158 aa  223  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0355687 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  70.13 
 
 		 154 aa  223  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  69.23 
 
 		 159 aa  221  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  66.88 
 
 		 158 aa  221  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  71.24 
 
 		 172 aa  220  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  70.13 
 
 		 154 aa  219  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  70.13 
 
 		 158 aa  220  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  70.59 
 
 		 158 aa  219  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  67.3 
 
 		 160 aa  219  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  67.92 
 
 		 159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  68.18 
 
 		 157 aa  217  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  68.15 
 
 		 157 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  67.52 
 
 		 157 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  67.52 
 
 		 157 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  66.88 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  68.15 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  68.18 
 
 		 158 aa  214  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  64.29 
 
 		 158 aa  211  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  65.61 
 
 		 157 aa  209  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  65.82 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  65.82 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  70.78 
 
 		 157 aa  209  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  65.82 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  65.82 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  65.82 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  64.94 
 
 		 154 aa  207  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  64.97 
 
 		 157 aa  207  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4160  bacterioferritin  68.83 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.902453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3897  bacterioferritin  68.83 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  64.52 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  64.1 
 
 		 159 aa  207  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  64.05 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  64.52 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  64.56 
 
 		 158 aa  203  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  64.94 
 
 		 154 aa  203  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  64.52 
 
 		 158 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  64.52 
 
 		 158 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  64.52 
 
 		 158 aa  202  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  64.52 
 
 		 158 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  62.58 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  64.52 
 
 		 158 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  64.52 
 
 		 158 aa  202  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  64.52 
 
 		 158 aa  202  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  64.52 
 
 		 158 aa  201  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  63.87 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  62.42 
 
 		 157 aa  201  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  61.69 
 
 		 154 aa  194  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  61.69 
 
 		 154 aa  194  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  61.44 
 
 		 159 aa  194  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  61.69 
 
 		 157 aa  193  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  61.69 
 
 		 157 aa  193  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  61.69 
 
 		 157 aa  193  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  60.9 
 
 		 162 aa  190  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  60.39 
 
 		 159 aa  190  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  60.39 
 
 		 154 aa  188  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0637  bacterioferritin  61.54 
 
 		 159 aa  184  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.444791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  58.44 
 
 		 168 aa  183  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1061  bacterioferritin  60.62 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  55.97 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2113  bacterioferritin  54.78 
 
 		 157 aa  181  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>