18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1950 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1950  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3499  hypothetical protein  39.66 
 
 		 175 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.128517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2094  hypothetical protein  34.87 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0202879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1322  hypothetical protein  36.49 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1366  hypothetical protein  36.36 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3208  putative CbiL protein  37.85 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3948  putative CbiL protein  35.98 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32 
 
 		 430 aa  75.9  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1960  hypothetical protein  31.53 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0757  hypothetical protein  29.7 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.321867  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2021  hypothetical protein  31.19 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000158905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1472  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3435  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  28.96 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1922  hypothetical protein  26.96 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1191  hypothetical protein  28.02 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000156419  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0895  hypothetical protein  28.57 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169761 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3137  hypothetical protein  30.72 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1132  hypothetical protein  24.11 
 
 		 148 aa  41.2  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.553572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>