19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1469 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1469  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  592  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  1.25637e-06 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1647  hypothetical protein  84.88 
 
 
290 aa  495  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14103  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1621  hypothetical protein  37.54 
 
 
301 aa  159  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.15267e-08  unclonable  3.74e-10 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0843  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 
247 aa  65.1  1e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000361866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0978  hypothetical protein  40.21 
 
 
256 aa  64.7  2e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0649  Tetratricopeptide repeat protein  28.48 
 
 
198 aa  64.7  2e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1003  tetratricopeptide TPR_4  36.08 
 
 
226 aa  59.7  5e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927358  hitchhiker  1.75577e-13 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4546  hypothetical protein  36.08 
 
 
266 aa  57.8  2e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154119  hitchhiker  5.13157e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5414  hypothetical protein  38.64 
 
 
262 aa  57.4  2e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0752  hypothetical protein  37.11 
 
 
258 aa  57.8  2e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443944  hitchhiker  1.79069e-09 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62190  hypothetical protein  38.64 
 
 
259 aa  57.8  2e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.417124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4791  putative lipoprotein  35.11 
 
 
248 aa  57.8  2e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0132705  hitchhiker  0.00029593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4680  hypothetical protein  36.08 
 
 
267 aa  57.8  2e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239335  hitchhiker  1.72604e-11 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4682  hypothetical protein  36.08 
 
 
266 aa  57.4  3e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1408  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 
181 aa  52.8  6e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0680  hypothetical protein  34.12 
 
 
193 aa  52.8  7e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1296  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
182 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  28.48 
 
 
938 aa  46.2  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42550  hypothetical protein  39.71 
 
 
185 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>