57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0946 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0946  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  200  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1472  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  88.89 
 
 		 100 aa  176  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0256438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0772  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  83.02 
 
 		 80 aa  100  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1052  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.78 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3580  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.43 
 
 		 70 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0452  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.44 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0935391  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1364  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.14 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.540828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2611  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  37.29 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38073  normal  0.51835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4262  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.29 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1606  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.29 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0765964  normal  0.010544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3827  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  32.84 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.24 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1874  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.22 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.308145  normal  0.762783 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2067  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1103  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.59 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0784477  normal  0.590624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1196  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.59 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1569  cytochrome oxidase maturation protein (cbb3-t)  46.67 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.246942  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2415  secretion protein HlyD  44.44 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0712  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  38.98 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720002  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5919  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.55 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.662161 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1047  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.55 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.372201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1995  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  29.85 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.407314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1276  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.22 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3323  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  36.76 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0243934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1815  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  30 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003473  type cbb3 cytochrome oxidase biogenesis protein CcoS involved in heme b insertion  42.22 
 
 		 54 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19940  cbb3-type cytochrome oxidase maturation protein  26.67 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02297  hypothetical protein  42.22 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0165  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.78 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0462  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  37.5 
 
 		 52 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1991  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.24 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2214  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  33.82 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365447  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2419  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.43 
 
 		 64 aa  42.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00562529  hitchhiker  0.0000013889 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5928  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.64 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.657419 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2164  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  33.82 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.123278  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2220  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.55 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.482957  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1953  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.96 
 
 		 82 aa  42  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4493  hypothetical protein  33.82 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1791  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  33.96 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1845  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.78 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224574  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2207  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  33.82 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2217  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 		 61 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2042  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  40 
 
 		 48 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.589343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0008  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.5 
 
 		 59 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2016  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.64 
 
 		 104 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2394  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  38.1 
 
 		 49 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1963  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.73 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2220  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.48 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000072597  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2012  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.96 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000291515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2113  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.96 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.110001  normal  0.234091 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0933  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177633  normal  0.669398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3783  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.86 
 
 		 46 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2358  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.48 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1275  signal peptide protein  40.91 
 
 		 58 aa  40.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1156  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  28.57 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.0826721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2045  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  37.78 
 
 		 48 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00305022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6714  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.1 
 
 		 45 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>