27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0084 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0084  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  811    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0756  hypothetical protein  65.09 
 
 
397 aa  498  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.608689  normal  0.219757 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0753  hypothetical protein  63.38 
 
 
393 aa  501  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.176602 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3690  hypothetical protein  45.29 
 
 
360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0805  hypothetical protein  45.62 
 
 
364 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0937  hypothetical protein  45.74 
 
 
364 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3881  hypothetical protein  43.04 
 
 
359 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0658  hypothetical protein  43.04 
 
 
359 aa  294  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.515936  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3793  hypothetical protein  43.04 
 
 
359 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.625203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0276  hypothetical protein  43.51 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1346  hypothetical protein  43.38 
 
 
359 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0899  hypothetical protein  41.09 
 
 
364 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1005  hypothetical protein  38.8 
 
 
374 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0581  hypothetical protein  35.05 
 
 
396 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4661  hypothetical protein  36.53 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5099  hypothetical protein  34.02 
 
 
370 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0141  hypothetical protein  33.5 
 
 
370 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5093  hypothetical protein  35.04 
 
 
370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1270  hypothetical protein  33.93 
 
 
369 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3011  hypothetical protein  34.54 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000441117  hitchhiker  0.000201325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3187  hypothetical protein  37.18 
 
 
384 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4763  hypothetical protein  34.52 
 
 
375 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33900  hypothetical protein  32.91 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0342  hypothetical protein  33.6 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3305  hypothetical protein  35.86 
 
 
385 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0294126  normal  0.309203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1064  hypothetical protein  32.99 
 
 
389 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.819996  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3668  hypothetical protein  31.33 
 
 
385 aa  152  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>