9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3421 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3421  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  9.28067e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3382  hypothetical protein  79.21 
 
 		 202 aa  346  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2796  hypothetical protein  68.12 
 
 		 207 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229034  normal  0.311657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0798  hypothetical protein  59.22 
 
 		 206 aa  273  9e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00459304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3234  hypothetical protein  59.7 
 
 		 210 aa  257  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2435  hypothetical protein  48.51 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0999  transposase  46.24 
 
 		 192 aa  174  8e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5698  hypothetical protein  44.71 
 
 		 209 aa  171  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1663  hypothetical protein  36.67 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000338743  normal  0.310155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>