22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0789 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  94.9 
 
 		 157 aa  310  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  91.72 
 
 		 157 aa  300  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  79.62 
 
 		 157 aa  263  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61450  hypothetical protein  69.23 
 
 		 157 aa  225  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.428854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5293  hypothetical protein  69.87 
 
 		 157 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  44.08 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  42.76 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  40.79 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  40.79 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2080  hypothetical protein  41.45 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0034  hypothetical protein  43.9 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  39.46 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  39.22 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  36.17 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  36.05 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02633  hypothetical protein  34.48 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  34.64 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0927  hypothetical protein  35.04 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000534724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5656  hypothetical protein  25.9 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1319  O-antigen related protein  32.81 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0766792  normal  0.774627 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12991  hypothetical protein  27.66 
 
 		 151 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>