More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3479 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.85671e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  2.61492e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  4.18169e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  2.2544e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.83398e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  2.07771e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  2.23138e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3408  transposase, IS4 family protein  98.45 
 
 
452 aa  918  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.73185e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.03535e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.27766e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.24968e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  3.2724e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.44429e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  99.56 
 
 
452 aa  927  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  2.4097e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.80348e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.91702e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  4.60419e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.20479e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.43207e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  99.78 
 
 
452 aa  929  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.02477e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
452 aa  931  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.55023e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  99.78 
 
 
452 aa  930  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  2.16314e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  99.56 
 
 
452 aa  927  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.4185e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0340  transposase IS4 family protein  65.11 
 
 
455 aa  623  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0786  transposase IS4 family protein  62.89 
 
 
455 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.980261  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2261  transposase IS4 family protein  62.89 
 
 
455 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2272  transposase IS4 family protein  62.89 
 
 
455 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2464  transposase IS4 family protein  62.89 
 
 
455 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1576  transposase IS4 family protein  62.89 
 
 
455 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0562343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0227  transposase IS4 family protein  62.89 
 
 
455 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1571  transposase IS4 family protein  62.44 
 
 
513 aa  584  1e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0160489  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0574  transposase IS4 family protein  62.67 
 
 
455 aa  575  1e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2634  transposase, IS4 family protein  58.09 
 
 
509 aa  549  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4074  transposase IS4 family protein  40.77 
 
 
440 aa  323  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3863  transposase IS4 family protein  40.77 
 
 
440 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0982  transposase, IS4 family protein  38.83 
 
 
441 aa  312  8e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.261869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1840  transposase IS1182 family protein  39.83 
 
 
447 aa  303  3e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2657  transposase IS1182 family protein  39.83 
 
 
447 aa  303  3e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817106  normal  0.241494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1782  transposase IS1182 family protein  39.83 
 
 
447 aa  303  3e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1665  transposase IS1182 family protein  39.83 
 
 
447 aa  303  3e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0171  transposase IS1182 family protein  39.83 
 
 
447 aa  303  3e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2730  transposase IS1182 family protein  39.83 
 
 
447 aa  303  3e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.271694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3052  transposase IS1182 family protein  39.83 
 
 
447 aa  303  3e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000434143  normal  0.286719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2711  transposase IS1182 family protein  39.83 
 
 
447 aa  303  3e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205202  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6804  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8347  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553537  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8445  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8505  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6465  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0788  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0645  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2688  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8169  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2233  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7792  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275885  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7856  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2029  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7596  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7909  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0378825  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7502  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121497  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8135  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0426  transposase  58.62 
 
 
199 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4843  transposase IS4 family protein  36.38 
 
 
444 aa  255  1e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0683585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3217  transposase IS4 family protein  36.18 
 
 
444 aa  235  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0903  transposase IS4 family protein  36.18 
 
 
444 aa  235  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0308  transposase IS4 family protein  36.18 
 
 
444 aa  235  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8194  transposase IS4 family protein  36.18 
 
 
444 aa  235  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7986  transposase IS4 family protein  36.18 
 
 
444 aa  235  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  33.26 
 
 
445 aa  229  7e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  9.12267e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  33.26 
 
 
445 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  3.5382e-10  unclonable  6.54827e-11 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  33.26 
 
 
445 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  5.17789e-10  hitchhiker  8.23353e-08 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0443  transposase  63.76 
 
 
163 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0697  transposase, IS4  31.64 
 
 
536 aa  216  9e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.876809  normal  0.052348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0412  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  2e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185935  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0387  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  2e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0612523  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0183  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  2e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0072  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  2e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.173128  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2025  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  2e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.469241  normal  0.684714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0439  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  2e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0484  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  2e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0590  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  2e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.366891  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1536  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  2e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1749  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  2e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.269011  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2643  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  2e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3125  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  2e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  unclonable  2.37223e-05 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0009  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  2e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.272991  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0628  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  3e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378407  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0350  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  3e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0269  transposase, IS4  31.44 
 
 
536 aa  214  3e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.464686  normal  0.0269922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0273  transposase, IS4  31.49 
 
 
516 aa  194  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0241108 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0145  transposase  28.9 
 
 
545 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1524  transposase  28.9 
 
 
545 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.419184  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1176  transposase  28.9 
 
 
545 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0416  transposase  28.9 
 
 
545 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.415118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3115  transposase  28.9 
 
 
545 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.960078  hitchhiker  0.00180053 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2792  transposase  28.9 
 
 
545 aa  181  3e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  27.79 
 
 
481 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  27.4 
 
 
481 aa  148  2e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>