21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0620 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  329  8e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  63.23 
 
 
154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  56.77 
 
 
156 aa  192  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  56.49 
 
 
154 aa  191  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  43.31 
 
 
159 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  38.82 
 
 
157 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61450  hypothetical protein  37.91 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.428854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  39.61 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5293  hypothetical protein  37.91 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  39.22 
 
 
157 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  38.56 
 
 
157 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  35.53 
 
 
157 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2080  hypothetical protein  38.82 
 
 
158 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0927  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000534724  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  32.3 
 
 
165 aa  95.1  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  38.85 
 
 
159 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02633  hypothetical protein  32.03 
 
 
180 aa  90.5  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0034  hypothetical protein  29.94 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  35.67 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5656  hypothetical protein  32.8 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1319  O-antigen related protein  32.84 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0766792  normal  0.774627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>