16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0790 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0790  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  335  2e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1558  hypothetical protein  69.57 
 
 
224 aa  231  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0299  hypothetical protein  51.55 
 
 
221 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153747  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2209  hypothetical protein  40.4 
 
 
225 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1567  hypothetical protein  51 
 
 
144 aa  88.6  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0996  CRISPR-associated protein, Csm2 family  37.6 
 
 
220 aa  75.9  2e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.462721  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2063  hypothetical protein  33.59 
 
 
214 aa  63.2  1e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336699  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2149  abortive phage resistance protein  31.29 
 
 
196 aa  61.2  5e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.744102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7389  hypothetical protein  32.54 
 
 
219 aa  60.1  1e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3540  hypothetical protein  28.57 
 
 
211 aa  57.4  8e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1293  hypothetical protein  30.43 
 
 
194 aa  57.4  9e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.464309  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0078  hypothetical protein  30.87 
 
 
232 aa  51.6  5e-06  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1042  hypothetical protein  28.19 
 
 
208 aa  48.1  6e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12610  hypothetical protein  30.07 
 
 
233 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11633  hypothetical protein  25.56 
 
 
257 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.389497  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2869  hypothetical protein  26.57 
 
 
223 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>